La organización de los contenidos en sus dimensiones vertical y horizontal se diseñó de lo básico a lo específico, es decir, se estructuraron los conocimientos en forma secuencial y lógica, de tal manera que, en su trayectoria académica, el residente médico vaya construyendo sus procesos de aprendizaje.

Para diseñar el mapa curricular y los programas analíticos se tomaron como parámetros las horas teóricas y prácticas por semana y los créditos por materia se calcularon según los criterios del acuerdo 17 del 2017, de la Secretaría de Educación Pública (SEP).

El Plan de Estudios del curso de medicina de la especialidad en Neumología Pediátrica, se cursa en dos años, contempla 27 cursos de 54 horas teóricas y 270 horas prácticas, dando un total de 324 créditos académicos, los cuales se encuentran distribuidos en materias o asignaturas, seminarios, cursos o talleres de acuerdo a la naturaleza de sus contenidos temáticos cuyos requisitos y prerrequisitos para ser cursados se indican en los programas analíticos que se elaboraron por materia.

El curso se encuentra estructurado de la siguiente manera:

1. Primer año contempla dieciocho materias con un total de 36 horas teóricas, 180 horas de práctica clínica, sumando 216 horas, lo que equivale a 216 créditos académicos.
2. Segundo año se diseñaron nueve materias con un total de 18 horas teóricas, 90 horas de práctica clínica, sumando 108 horas, para 108 créditos académicos.